Bursa Teknik Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi bünyesinde yer alan Bilgisayar Mühendisliği Bölümü 2015 yılında kurulmuştur. 2016 yılında KHK ile kapatılan Bursa Orhangazi Üniversitesi'nin Bilgisayar Mühendisliği (İngilizce) bölümü öğrencilerinin eğitimlerini sürdürebilmesi amacıyla YÖK tarafından bölümümüz İngilizce olarak eğitime başlamıştır. Bu öğrencilerin tamamının mezun olması ile program kapatılmıştır.  Bilgisayar Mühendisliği (Türkçe) programı ise 2018 yılında isteğe bağlı İngilizce hazırlık sınıfı seçeneğiyle kurulmuş olup ilk öğrencilerini 2018 Üniversite Giriş sınavı sonuçlarıyla almıştır. ÖSYM girişli öğrenciler ile 2022 yılından beri mezun verilmektedir.